Haplogruppen werden verwendet, um genetisch verwandte Personengruppen innerhalb der Bevölkerungen zu definieren. Alle Mitglieder der gleichen Haplogruppe lassen sich auf einen gemeinsamen Vorfahren zurückführen. Haplogruppen kann man sich als grosse Äste des Homo Sapiens Stammbaumes vorstellen. Jede Haplogruppe fasst Menschen zusammen, deren genetisches Profil ähnlich ist und die einen gemeinsamen Vorfahren teilen. Dabei gehören Männer einer Haplogruppe des Y-Chromosoms an, die über einen gemeinsamen Vorfahren in rein väterlichen Linie verfügen. Das Y-Chromosom wird immer vom Vater an den Sohn weitergegeben.

Diese Haplogruppen-Äste zeigen, wie sich Bevölkerungsgruppen geografisch und zeitlich auf der Erde verbreitet haben. Haplogruppen definieren also zunächst geographische Regionen. Ältere Haplogruppen sind grösser und weiter verbreitet, von Ihnen stammen zahlreiche jüngere Untergruppen (Subclades) ab.

Zeitlich sprechen wir bei den einzelnen Haplogruppen von großen Menschheits-Zeitepochen. Legt man hier die 4 Haplogruppen zu Grunde, so haben alle 4 Haplogruppen einen gemeinsamen ersten Vorfahren der Haplogruppe „A-PR2921“, der vor ca. 240.000 Jahren in Afrika lebte. Diese Haplogruppe entwickelte sich im Laufe der Menschheitsgeschichte in Epochen weiter von bis zu 40.000 Jahren je Haplogruppe durch Mutationen bis hin zur letzten gemeinsamen Haplogruppe „HIJK-PF3494“ vor 57.000 Jahren.   

Mit Hilfe eines Tool von Rob Spencer (SNP-Tracker) wurden für die 4 relevanten Haplogruppen Grafiken generiert. Die nachfolgenden Grafiken zeigen eindrucksvoll, dass Probanden mit unterschiedlichen Haplogruppen von vornherein nicht miteinander verwandt sein können, obwohl alle den gleichen Familiennamen tragen (Ausnahme bei unehelichen Geburten, wo Vorfahren den Familiennamen der Mutter weitergeführt haben):

-   Gemeinsame Haplogruppen bis HIJK-PF3494 (vor 57.000 Jahren), danach regionale Trennung

-   Wanderung Völkergruppen Haplogruppen R-M198 (vor 14.000 Jahren) und R-M269 (vor 13.000 Jahren) nach Osten und ab Haplogruppe P-P226 (vor 35.000 Jahren) nach Westen, weitere Mutationen nach der Haplogruppe R-M173 (vor 23.000 Jahren) in zwei Richtungen

-   Wanderung Völkergruppen Haplogruppe I-M170 (vor 43.000 Jahren) gleich nach West und Weiterentwicklung in Haplogruppe I-M253 (vor 28.000 Jahren) in Richtung Nord-Westen.

Bei den Probanden der Reihen 15, 16, 17 und 18 handelt es sich um direkte Verwandte 3. Grades (die Urgroßväter waren Brüder), deren Vorfahren erstmals 1775 in Preussisch Holland (Ostpreußen) erkannt worden sind (Verwandtschaft durch Papierforschung und autosomale DNA bestätigt). Die genetische Distanz zwischen den Probanden bestätigt die Verwandtschaft auf der rein väterlichen Seite, da die Werte mit „0“ bzw. maximal „1“ sehr dicht sind und daher keinen Zweifel zulassen.  

Folgerichtig müssen auch alle 4 Probanden die gleichen Y-Matches bei FamilyTreeDNA haben. Die nachfolgenden Grafiken wurden für jeden einzelnen Probanden bei FamilyTreeDNA mit der Funktion „Matches Maps“ und der Einstellung „Y-DNA 12 Marker“ generiert. Die meisten Treffer auf der Ebene „Y-DNA 12 Marker“ sind zwar sehr alt, da die gemeinsamen, genetischen Merkmale zum größeren Teil aus der Kupfer- und Bronzezeit stammen (5.500-800 v. Chr.). Im vorliegenden Fall zeigen die Grafiken aber durch ihre absolute Übereinstimmung der Y-Matches die enge Verwandtschaft zwischen den 4 Probanden auf. 

Ferner verdeutlichen die Grafiken, von wo die ersten, bekannten Vorfahren der Probanden (Y-Matches) regional ursprünglich stammen. Die Grafiken zeigen hier eindrucksvoll den regionalen Schwerpunkt Großbritannien und Irland sowie die Niederlande und West-/Südwest-Deutschland. Dieser regionale Schwerpunkt ist als eine einheitliche Region für die Vorfahren der 4 Probanden anzusehen, da das optische Übergewicht von Großbritannien und Irland nur auf die höhere DNA-Testbereitschaft britischer Probanden zurückzuführen ist.